Genetic relationship and diversity among some Moroccan and introduced rapeseed (Brassica napus L.) varieties as revealed by molecular markers | OCL

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Table 3

ISSR primers and amplification results of 20 ISSR primers used for the molecular characterization of 22 rapeseed varieties.

Primer	AT (°C)	SB	TNB	NPB	NMB	PPB	EMR	MI	PIC
F1	43	184-1122	19	18	1	94.74	17.05	6.41	0.38
F2	58	192-808	14	9	5	64.29	5.79	2.07	0.36
F3	43	270-934	15	11	4	73.33	8.07	3.4	0.42
F4	58	167-1329	20	16	4	80	12.8	4.57	0.36
F8	56	161-1249	22	18	4	81.82	14.73	6.08	0.41
F9	43	237-765	13	9	4	69.23	6.23	2.43	0.39
F11	56	176-718	17	16	1	94.12	15.06	4.44	0.3
F16	58	238-1220	18	14	4	77.78	10.89	3.82	0.35
IMA-5-Z	56	171-966	18	16	2	88.89	14.22	4.72	0.33
IMA9Z	56	185-726	11	11	0	100	11	3.7	0.34
IMA834z	50	175-911	16	13	3	81.25	10.56	4.54	0.43
IMA8Z	50	166-935	15	14	1	93.33	13.07	4.9	0.38
IMA834-2	50	175-1122	15	10	5	66.67	6.67	3.39	0.51
UBC808-2	50	193-984	19	11	8	57.89	6.37	2.28	0.36
UBC810	50	190-929	16	13	3	81.25	10.56	3.35	0.32
UBC850	50	265-1311	14	11	3	78.57	8.64	2.78	0.32
UBC856	56	137-985	15	14	1	93.33	13.07	4.48	0.34
IMA12-2	56	210-1085	16	15	1	93.75	14.06	5.23	0.37
ISS F1	50	299-1213	14	13	1	92.86	12.07	3.69	0.31
ISSR1	56	183-717	12	8	4	66.67	5.33	2.13	0.4
Average	52.25	–	15.95	13	2.95	81.4885	10.812	3.9205	0.369

AT: annealing temperatures; SB: size of bands (bp); TNB: total number of bands; NPB: number of polymorphic bands; NMB: number of monomorphic bands; PPB: percentage of polymorphic bands; EMR: effective multiple ratio; MI: marker index; PIC: polymorphic information content.

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