Le programme Génoplante, programme mobilisateur en génomique végétale

Feature: Genomics and the Oilseed Sector The Genoplante programme: a mobilizing programme in plant genomics

Unité de recherche en génomique végétale, Inra, 2, rue Gaston-Crémieux, CP 5708, 91007 Évry Cedex

Résumé

Les enjeux de la génomique végétale sont immenses pour le secteur de la création variétale et concernent de multiples objectifs, allant de la réduction d’intrants à l’amélioration de la qualité des produits récoltés ou transformés. Une situation d’oligopole se met en place au niveau mondial avec quelques firmes provenant du secteur de la chimie, principalement aux États-Unis avec de très forts soutiens publics. En 1998, l’Inra, le CNRS, le Cirad, l’IRD pour le secteur public et Biogemma, Aventis Crop Ssciences et Bioplante pour le secteur privé s’engagent dans le programme Génoplante, acté, en février 1999, par le ministère de la Recherche, qui y apporte son soutien, pour une première période de cinq ans, afin de permettre à nos recherches, fondamentale et appliquée en biologie végétale, de rester compétitives. Le programme Génoplante comprend d’abord des programmes génériques : analyse fonctionnelle du génome d’Arabidopsis, génomique du riz, nouveaux outils d’analyse des génomes, bio-informatique, cibles importantes dans le génome des plantes cultivées. L’évaluation des projets soumis dans ce cadre est réalisée par des experts internationaux indépendants. Globalement, plus de 300 chercheurs sont impliqués dans ces projets. Il comprend aussi des programmes par espèces (blé, maïs, colza, tournesol, pois) ayant chacun une partie générique (cartographie physique, banques génomiques, etc.) et des projets concernant des caractères agronomiques, des stratégies de résistance aux maladies, ou des objectifs de caractérisation et d’amélioration de la qualité des produits.

Abstract

Plant genomics issues are vast for plant breeding and apply to multiple objectives, from input reduction to improvement of harvested or transformed products. A situation of oligopoly is currently being set up worldwide with some companies from the chemical industry sector, essentially in the United States, where they enjoy a very important public support. In 1998, the Inra, CNRS, Cirad, IRD for the public sector and Biogemma, Aventis Crop Sciences and Bioplante for the private sector, became involved in the Genoplante programme which was formally recorded in February 1999 by the French Ministry of Research which sustained it for a first 5-year period in order to allow our fundamental and applied research sectors to remain competitive. The Genoplante programme firstly comprises generic programmes: functional analysis of the Arabidopsis genome, rice genomics, new tools in genome analysis, bioinformatics, important targets in the genome of crop plants. The appraisal of submitted projects in this framework is carried out by a panel of independent international experts. As a whole, more than 300 researchers are involved in these projects. It also comprises species-based programmes (corn, pea, rapeseed, sunflower, wheat), each of which being composed of a generic part (physical mapping, genomic library, etc.) and of projects concerning agronomic characters, strategies for disease resistance and characterisation and improvement of the quality of products.