DEFENSE DES CULTURES La nécrose du collet du colza : analyse de la distribution du champignon dans la plante à l’aide d’outils moléculaires

Crop Protection Stem canker in oilseed rape. Analysis of the distribution of the fungus in the plant using molecular tools

Inra, PMDV, CR de Versailles, route de Saint-Cyr, 78026 Versailles Cedex, France

Résumé

Les composantes (Tox+ et Tox0) du complexe impliqué dans la nécrose du collet du colza ont été suivies au cours du temps et dans la plante, à l’aide d’outils moléculaires (ITS, ISSR), afin de clarifier leurs rôles respectifs dans les dégâts de nécrose, de préciser les relations entre les symptômes foliaires précoces et les nécroses du collet tardives et d’évaluer l’étendue de la colonisation de la plante, en conditions naturelles, pendant deux cycles culturaux successifs. Les deux composantes, présentes en permanence, varient en proportion selon la période de culture et l’organe considérés. La composante Tox+, qui prédomine aux deux extrêmes du cycle cultural, sur feuille en automne et au collet en fin de végétation, est responsable des dégâts de nécrose. L’analyse topographique de la région du collet indique que tous les tissus, fortement colonisés par de nombreuses souches Tox+ distinctes, constituent un site privilégié de confrontation entre souches différentes, favorable à la reproduction sexuée du champignon.

Abstract

Tox+ and Tox0 isolates of Leptosphaeria maculans complex causing stem canker of winter oilseed rape were surveyed with the help of molecular tools (ITS, ISSR), in selected plants over two growing seasons. The aim was: (i) to clarify respective contribution of Tox+ and Tox0 to disease severity; (ii) to link primary foliar symptoms to late crown canker; (iii) to compare Tox+ and Tox0 colonisation in natural environment. Both types of isolates were permanently present with variable ratios according to plant organs and period in the growing season. Tox+ isolates, prevalent at both ends of the growing season, leaves in autumn, crown in June, are primarily responsible for stem canker. All tissues of crown area were heavily colonised by numerous Tox+ individuals. The crown area represents a favourable location for interactions between isolates and for sexual reproductive phases of the fungus lifecycle.